По итогам 2020 года пассажиропоток Аэропорта ТОМСК составил 348 431 пассажиров. Количество человек, которые воспользовались внутренними воздушными линиями (с учетом транзита) составило 331 796 пассажиров. На международных линиях пассажиропоток составил 16 человек.